(现场清除死鱼)熊本县水产研究中心的负责人指出，由于当地海域的洋流流向变化快速，难以找出沙丁鱼死亡的确切地点，再加上死鱼已经开始严重腐烂，所以很难查出其大量死亡的原因。不过从目前的情况来看，沙丁鱼集体感染死亡的可能性很低。如果是感染死亡的话，那么渔港以外的鱼也会死亡才对。沙丁鱼一般是结群而行。有一种可能性是，沙丁鱼群被大鱼追赶后大量进入渔港，水温、盐度存在差异，最终缺氧而死。附近的水族馆馆长河野壮志分析称：“熊本天草一带属于内湾地形，当地的海水循环可能不是很好，当大量的鱼涌入时就可能会引发缺氧状况。”
(日本媒体报道截图)10月18日上午10点左右，熊本县天草市的70多名工作人员来到现场，开始用网清除死鱼。后来可能是发现死鱼太多了，靠人力太慢，又投入吊车来到现场作业。
(现场清除死鱼)截至10月19日，仅仅两天时间，现场清除的死鱼总重量就已经超过90吨。全部死鱼可能在100吨以上。
(现场清除死鱼)天草市政府经济部长宫本周幸表示，这些沙丁鱼应该是在死亡后沉入水中，后来才又浮出水面。“一直捞一直捞，死鱼还是不断从水面下浮出来。”“只能祈祷死鱼不要再增加了，总之我们现在会尽力把已经浮出海面的鱼全部清完。”
(天草市政府经济部长宫本周幸)大量沙丁鱼死亡的原因，目前还不清楚。天草市决定暂时将回收的死鱼冷冻保存起来，今后可能会将死鱼加工成肥料。
(天草市考虑将死鱼加工成肥料) 熊本县天草市市长马场昭治表示：“希望尽快清除死鱼，让市民回归正常生活。还有关于渔民的生计，我们也将认真考虑应对。”
(天草市市长马场昭治)就此事件，日本网友议论纷纷：“长崎和熊本发生沙丁鱼大规模非正常死亡事件。原因不明。这是否预示着自然环境将发生重大变化?”
“是污染水吧。”
“是大地震的预兆嘛。”
“希望能好好进行调查。”
“如果超市里有熊本产的沙丁鱼出售，其他地区的人们要小心了。”
